Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms