Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC39A12Q504Y0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms