Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms