Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms