Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms