Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms