Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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