Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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