Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NRF1Q16656 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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