Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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