Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms