Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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