Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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NPTX1Q15818 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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