Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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