Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms