Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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