Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3GAP1Q15042 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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