Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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