Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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