Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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