Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IHHQ14623 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms