Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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