Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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