Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms