Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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