Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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