Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PWP1Q13610 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PWP1Q13610 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms