Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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