Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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