Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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