Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R2Q13319 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R2Q13319 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms