Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms