Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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