Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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