Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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