Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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