Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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