Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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