Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXF1Q12946 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXF1Q12946 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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