Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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