Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms