Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNTN1Q12860 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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