Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms