Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms