Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms