Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms