Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME1Q06323 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms