Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms