Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EMX2Q04743 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms