Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREMQ03060 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREMQ03060 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREMQ03060 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms